טיפול שורש (המוכר גם בשם טיפול אנדודונטי) הינו טיפול שיניים נפוץ למדי, שנועד לטפל בשיניים הנגועות בדלקת חריפה של מוך השן, שהינו רקמה רכה של כלי דם ועצבים המצויה בתוך השן. טיפול שורש מאפשר לשמר שיניים, שבעבר לא היה מנוס מעקירתן. כיום, טיפולי שורש מצליחים למנוע ברובם המכריע של המקרים עקירת שיניים, תוך הותרת השן המקורית דבר שהינו על פי רוב עדיף מבחינה בריאותית וכדאי גם מבחינת עלויות (שכן השתלת שיניים, תותבות או גשרים הינם לרוב טיפולים מורכבים יותר, הכרוכים בעלויות גבוהות, ולעתים אין הם מהווים תחליף המשתווה לשן המקורית).
ככלל, טיפול שורש המבוצע במרפאת שיניים יכול להתבצע במפגש אחד או בסדרת טיפולים, וזאת בין היתר בהתאם לחומרת הדלקת, מספר תעלות השורש בשן ומבנה השן.