בשנים האחרונות נפתחו בישראל מרפאות שיניים רבות, בין היתר כתגובה לביקוש ולפופולריות של השתלות שיניים, שהופכות אט אט לבחירה המועדפת על ידי מטופלים רבים. לגורמים אלו מצטרפות סיבות נוספות, ובהן למשל, האפשרות של מרפאות שיניים לצמצם בעלויות לעומת מרפאות פרטיות (דבר המאפשר למרפאות שונות להציע הצעות  אטרקטיביות מבחינת מחירם של טיפולי שיניים); יכולתן של מרפאות שיניים גדולות להעמיד תשתיות חדשות וציוד חדש בהוצאה נמוכה יחסית ביחס למספר הרופאים המטפלים; חלק ממרפאות השיניים הינן בבחינת one-stop-shop בהן ניתן לבצע טיפולי שיניים המחייבים מעורבות של מספר מומחים ללא צורך בהפניה לרופאים אחרים (יש מרפאות שיניים הערוכות לביצוע טיפולי שיניים מורכבים אף בהרדמה מלאה); העובדה שמרפאות שיניים נהנות במקרים רבים מאמון הציבור, הנובע מכך שמדובר במרפאה המגובה במספר רופאים ולא ברופא שיניים בודד (למרות שלעתים, אמון זה והנחות היסוד בדבר עדיפותן של מרפאות שיניים על פני מרפאות פרטיות, שגויות או שאינן מבוססות כלל) ועוד.

אלא שלעתים, הנחות היסוד עליהן מתבססים אנשים רבים הבוחרים לבצע טיפול שיניים דווקא במרפאת שיניים מסויימת ולהעדיף מרפאת שיניים על פני מרפאה פרטית של רופא שיניים, הינן שגויות. יש מטופלים שמבססים את ההחלטה לפנות למרפאת שיניים מסויימת על פי פרסום בלבד; יש הבוחרים המרפאת שיניים בגלל המחיר או בגלל המיקום ועוד - למרות שדומה כי השיקולים העיקריים בעת קבלת החלטה האם לבצע טיפול שיניים במרפאת שיניים, צריכים להיות איכות וטיב הטיפול שיינתן במרפאה ונסיונם ומקצועיותם של הרופאים שיבצעו את טיפול השיניים.

ניתן אם כן למנות מספר כללים לשמש ככלי עזר לבחירת מרפאת שינים:

1. חשוב שמעבר לפרסום יובטח כי רופא השיניים שיטפל בכם במרפאת השיניים יהיה אכן מומחה בתחומו. מומלץ לברר מראש מי רופא השיניים המטפל, מה הכשרתו ומה נסיונו, במיוחד אם מדובר בטיפול מיוחד, כגון טיפול שורש, יישור שיניים או השתלת שיניים. אם הנכם מעוניינים בביצוע טיפול שיניים תחת הרדמה מלאה, יש לוודא כי ההרדמה תבוצע על ידי רופא מרדים מומחה, בעל נסיון, בו הינכם בוטחים, ולאחר שנבחנה ההיסטוריה הרפואית שלכם ונקבע כי אין מניעה לביצוע הרדמה מלאה.
2. רבים סבורים כי עדיף לבחור מרפאת שיניים בה ניתן ונהוג לקיים היוועצויות של יותר מרופא אחד, במקרים של טיפולי שיניים מורכבים, או כאשר נדרשת מעורבות של כמה מומחים. מדובר באחד היתרונות במרפאות שיניים המרכזות מספר מומחים, היכולים יחד להסתכל על כמה שלבים בטיפול באופן כולל המאפשר תכנון מייטבי.
3. כדאי לברר מה מצב התשתיות, הציוד והמיכשור של מרפאת השיניים, בין על ידי קבלת חוות דעת של אנשים שטופלו באותה מרפאת שיניים או לעתים גם בדרך של ביצוע ביקור מקדים במרפאת השיניים.
4. לעתים, מרפאת שיניים שהינה בעלת התמחות ספציפית, יכולה להיות הבחירה הנכונה - בפרט אם מדובר בטיפול שיניים מורכב כגון השתלות שיניים או טיפולי שורש.
5. חשוב לא לתת לשיקול הכספי להכריע בעת בחירת מרפאת שיניים. ברור כי עלות טיפולי השיניים הינה שיקול רלוונטי, ואין להתעלם ממנו, אך חשוב לזכור כי בראש ובראשונה יש להבטיח שהטיפול אותו תבצעו, יבוצע באופן איכותי ובטוח. לעתים הצעות של מרפאות שיניים שנשמעות מפתות באופן חריג, צריכות להדליק נורה אדומה ובחינה מוקדמת דקדקנית של מרפאת השיניים, חוות דעת מטופלים וכיו”ב.
6. רבים מציעים להיזהר מפרסומים של מרפאות שיניים או הבטחות שאינם מבוססים - במיוחד לגבי עלויות הטיפול ומשך הטיפול. יש לנקוט משנה זהירות ביחס למרפאות שיניים המתפארות בקיצור משך הטיפול (רלוונטי למשל בתחומי השתלת שיניים או יישור שיניים, הנמשכים לרוב תקופה ארוכה), שכן בטיפולי שיניים רבים, החיפזון הוא מן השטן. באופן דומה, גם הצעות מחיר מפתות צריכות לעורר חשד, שמא אין הן כוללות את כל העלויות שיידרשו להשלמת הטיפול או שמא המחיר בא על חשבון טיב הטיפול.